rna免疫沉淀rip实验原理
细胞裂解后,孵育结合了抗体的珠子,诱饵蛋白通过其抗体结合到beads上,同时和诱饵蛋白互作的rna,也一起沉淀到beads上。洗涤掉未结合的rna后,再用洗脱液将rna-蛋白复合物从beads洗脱下来,便得到rna免疫沉淀产物。rip产物既可用qpcr检测已知rna,也可以二代测序检测未知rna。 当没有合适的诱饵蛋白抗体时,可以通过表达融合了flag标签的诱饵蛋白,利用flag标签做免疫沉淀。即细胞过表达flag-bait,经裂解后与anti-flag珠子孵育,诱饵融合蛋白与beads结合,与诱饵融合蛋白互作的rna“共沉淀”到beads上,再经洗涤、洗脱后做qpcr或ngs测序。
rna免疫沉淀rip实验流程
rip实验,rna结合蛋白免疫共沉淀,rip-seq检测实验.jpg
带标签的rna免疫共沉淀流程图:
rip-qpcr,rip技术实验,rip实验外包.jpg
rna免疫沉淀rip技术应用
筛选或验证与诱饵蛋白互作的rna
rna免疫沉淀rip服务*辉骏势
1. 近十年服务经验,客户成果发表在nature methods,cell research等高水平期刊上; 2. 可对围绕rna结合蛋白开展的整体课题提供***方案建议; 3. 自有分子及细胞生物实验平台,能有制定并执行***的实验路线; 4. 售后技术支持将一直保持到客户发表文章,***客户安心进行下游实验及投稿。
rna免疫沉淀rip服务信息
项目名称
客户提供
结果交付
实验周期
rip qpcr
实验样本 诱饵蛋白的ip级抗体 实验信息表(样本信息,诱饵蛋白及待测蛋白信息)
1、诱饵蛋白wb检测图 2、待测基因qpcr检测结果 3、实验报告
3-4周
rip seq 实验样本 诱饵蛋白的ip级抗体 实验信息表(样本信息,诱饵蛋白信息) 1、诱饵蛋白wb检测图 2、测序结果 3、实验报告
6-7周
rna免疫共沉淀rip 客户文献
1. bao . et al: capturing the interactome of newly transcribed methods,15(3): 213–220. 2018,if=28.467. 【研究内容】:辉骏生物为作者单位,和作者共同开发了一种捕获鉴定新生rna结合蛋白的全新方法(rick)。该方法用eu标记新生rna,通过***反应-生物素-链霉亲和素系统结合z谱分析,分离鉴定rna互作蛋白。其中,mettl1和cdk1是两个rick***的rna结合蛋白。 rip-qpcr、rip-seq、clip-seq等实验进一步证实了它们与非polya rna的结合,这种结合在***与增殖中发挥了重要作用。 使用相关技术:rip-qpcr、rna免疫共沉淀rip-seq、rna结合蛋白免疫沉淀技术
2. bao. . et al: the p53-induced lincrna-p21 derails somatic cell reprogramming by sustaining h3k9me3&cpg methylation at pluripotency gene promoters. cell research.2015, if=13.9.
【研究内容】:客户利用rna pull down、coip等技术,发现lincrna-p21与hnrnpk结合,并和***化酶setdb1、dnmt1形成复合物,作者通过rip-qpcr进一步证实了细胞中存在该复合物。该复合物***化了多能性基因的启动子序列及相应组蛋白,并改变了它们的表达量,从而进一步影响体细胞重编程过程。
使用相关技术:ripseq、rna结合蛋白免疫共沉淀rip qpcr、z谱鉴定 |
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